Вже не один раз напоровся на такий Ворнінг:

Warning: bcompiler: Bad bytecode file format at 00000000

Проблема, особисто в мене, виникала при спробі підключити порожні файли (include(), require(), include_once(), require_once() ). Причому навіть не порожні файли розміром 3 і менше байти також видавали подібні повідомлення!

Проблема в PECL модулі bcompiler до версії 1.110. Тому не лякайтеся, якщо побачите такий Warning, просто додайте там 4 пробіли або <?php /* */ ?> і це одразу обійде проблему

Чистого вам кодінгу, без Warning -ів! ))